MTsN Amuntai  Utara di bulan Agustus tahun 2016 berdasarkan keputusan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 671 Tahun 2016 berubahan nama menjadi MTsN 6 Hulu Sungai Utara. Dulu bernama MTs. As Salam yang berdiri pada bulan Juni tahun 1985 atas pemikiran tokoh masyarakat, camat dan lembaga lain yang terkait. Karena pada waktu itu jarak Sekolah Lanjutan Tingkat Pertama yang ada cukup jauh dan sangat memungkinkan untuk membangun atau mendirikan suatu lembaga pendidikan yang bercirikhas agama Islam. Reaksi masyarakat juga sangat mendukung karena pada waktu itu keadaan masyarakat / ekonomi yang rendah didukung karena banyaknya Sekolah Dasar disekitar  desa tersebut.

Pada tahun 1997 berdasarkan SK Menteri Agama RI No. 107 tahun 1997 yang kemudian peresmiannya oleh Bupati Kepala Daerah Kabupaten Hulu Sungai Utara pada tanggal 19 April 1997, terletak di Desa Sungai Turak Kabupten Hulu Sungai Utara.

Lokal belajar yang digunakan adalah bekas SDN Sungai Turak 2, yang diciut dan diserahkan kepada MTsN 6 Hulu Sungai Utara untuk pemanfaatannya.

Dalam perjalanan selanjutnya MTsN 6 Hulu Sungai Utara secara bertahap telah mengalami kemajuan baik dari segi kualitas maupun kuantitas. Dibidang pengadaan sarana dan prasarana pendidikan MTsN 6 Hulu Sungai Utara telah berupaya untuk melengkapinya. Melalui bantuan rehabilitasi berat dengan menggunakan dana JSE maupun bantuan imbal swadaya, ditambah dengan adanya bantuan pembangunan ruang kelas baru.

Ditunjang dengan adanya bantuan fasilitas pembelajaran seperti : Bahan pustaka (fiksi dan non fiksi) alat-alat laboraturium bahasa, alat-alat keterampilan, alat-alat olah raga, alat peraga IPS sehinga pada tanggal 13 Juli 2001 MTsN Amuntai Utara ditunjuk sebagai Sekolah Percobaan (Trial School) sesuai SK Kepala Dinas Pendidikan Kalimantan Selatan No. Kep. 036/PP/Disdik/2001.

Pada saat penegerian MTsN 6 Amuntai Utara dikepalai oleh Drs. Shabirin B. Saberi, Drs. Marjuki, Abdu Syahid, S.Pd,MM.Pd, Drs. H. Herli Ruspiani, MM,  H. Tamjidillah, S.Ag, Drs. H. M.Asy’ari.M.M, Muhammad Ridha, S.Ag., MA Sampai Sekarang.

Keterangan :